具有較強的科技創(chuàng)新能力。有中醫(yī)學、中藥學、中西醫(yī)結(jié)合3個博士后科研流動站，設(shè)有4個研究所、6個研究室，2個國家中醫(yī)藥管理局重點研究室，3個山東省工程技術(shù)研究中心�！笆�一五”以來，共承擔廳局級以上科研課題739項，其中國家級項目143項。在省屬高校中首家主持國家“973”項目1項，承擔“973”項目課題3項，牽頭國家“十一五”科技支撐計劃項目4項，財政部“中醫(yī)藥古籍保護與利用能力建設(shè)”重大專項1項；國家重大、重點科研項目累計科研經(jīng)費突破1億元，中醫(yī)臨床研究基地建設(shè)資金2.8億元；獲國家科技進步二等獎2項，省部級獎勵78項、廳局級獎勵77項。是科技部認定的“國家科技成果重點推廣項目技術(shù)依托單位”、“國家中藥現(xiàn)代化、產(chǎn)業(yè)化規(guī)范種植項目承擔單位”。

學校注重加強學科建設(shè)，形成了一批優(yōu)勢和特色學科�，F(xiàn)有中醫(yī)基礎(chǔ)理論、中醫(yī)醫(yī)史文獻2個國家重點學科和中醫(yī)內(nèi)科學1個國家重點（培育）學科。1個教育部重點實驗室，1個國家衛(wèi)生部技術(shù)準入�？�；國家中醫(yī)藥管理局重點學科12個、重點�？�(專病)3個、重點建設(shè)�？�5個、重點實驗室6個；有山東拾泰山學者”崗位學科6個，山東省人文社科研究基地1個，省級重點學科、重點�？�、重點實驗室等14個。

學校，以鄧小平理論和“三個代表”重要思想為指導，深入貫徹落實科學發(fā)展觀和黨的教育方針，以建設(shè)高水平特色名校為目標，以科學發(fā)展為主題，以人才培養(yǎng)為根本任務(wù)，以提高質(zhì)量和科技創(chuàng)新為主線，以解放思想、深化改革為動力，凝聚全校師生的力量，統(tǒng)一思想，搶抓機遇，突出特色，奮發(fā)進取，以高昂的斗志、扎實的工作，全面推進高水平特色名校建設(shè)，正在為實現(xiàn)山東中醫(yī)藥大學新的歷史性跨越而努力奮斗！